Recurring(継続支払い)はAmazon側が自動で課金を行う仕組みではありません。事業者側で2回目以降の課金を行う必要があります。
Recurring(継続支払い)では課金の金額・タイミングは事業者側で自由にコントロールすることができます。課金の金額・タイミングをECサイトで管理してバッチ処理等で1件ずつ createCharge APIを呼び出してください。
※課金可能な金額はChargePermission(Recurring)毎に月額100,000円までになります。
参考
継続支払いの管理